Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tff2Q03404 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tff2Q03404 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tff2Q03404 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms