Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnb1P62874 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnb1P62874 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms