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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
DAL7
YIR031C
1665 nt
7.36
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
RSA3
YLR221C
663 nt
7.36
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
YBR138C
YBR138C
1575 nt
7.36
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
SVF1
YDR346C
1446 nt
7.35
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
MSS116
YDR194C
1995 nt
7.35
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
YER137C
YER137C
447 nt
7.35
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
DOC1
YGL240W
753 nt
7.35
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
KAE1
YKR038C
1161 nt
7.35
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
YNL194C
YNL194C
906 nt
7.35
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
TOP3
YLR234W
1971 nt
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□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
POB3
YML069W
1659 nt
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□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
SUF3
tG(CCC)D
72 nt
7.34
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
PET117
YER058W
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□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
SKG1
YKR100C
1068 nt
7.34
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
TAF4
YMR005W
1167 nt
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RTA1
P53047
SPS22
YCL048W
1392 nt
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□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
CDC7
YDL017W
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7.33
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
SDH8
YBR269C
417 nt
7.33
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
SEC24
YIL109C
2781 nt
7.33
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
RDR1
YOR380W
1641 nt
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□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
TOD6
YBL054W
1578 nt
7.33
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
LAG2
YOL025W
1983 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
PMA2
YPL036W
2844 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
LYS12
YIL094C
1116 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
YML122C
YML122C
381 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
YMR074C
YMR074C
438 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
PHA2
YNL316C
1005 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
ATP4
YPL078C
735 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
CIT2
YCR005C
1383 nt
7.32
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
FCY2
YER056C
1602 nt
7.31
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
CNM67
YNL225C
1746 nt
7.31
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
BPL1
YDL141W
2073 nt
7.31
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
PCL10
YGL134W
1302 nt
7.3
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
BNA3
YJL060W
1335 nt
7.3
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
GPI18
YBR004C
1302 nt
7.3
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
GUS1
YGL245W
2127 nt
7.3
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
IRC11
YOR013W
471 nt
7.3
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
RPL43A
YPR043W
279 nt
7.3
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
AQR1
YNL065W
1761 nt
7.3
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
WHI4
YDL224C
1950 nt
7.29
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
ENB1
YOL158C
1821 nt
7.29
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
YEN1
YER041W
2280 nt
7.29
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
PET112
YBL080C
1626 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
RGT2
YDL138W
2292 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
YHP1
YDR451C
1062 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
EDC2
YER035W
438 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
YJR115W
YJR115W
510 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
LOT6
YLR011W
576 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
ATP23
YNR020C
813 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
YNL040W
YNL040W
1371 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
MHP1
YJL042W
4197 nt
7.28
□□□□□ -1.24
RTA1
P53047
YPQ2
YDR352W
954 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
CBT1
YKL208W
816 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
ADH6
YMR318C
1083 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
MOD5
YOR274W
1287 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
DPM1
YPR183W
804 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
BSC5
YNR069C
1470 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
CMR1
YDL156W
1569 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
EXG2
YDR261C
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
TOM71
YHR117W
1920 nt
7.27
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
PGI1
YBR196C
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
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YCR041W
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
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YGR291C
222 nt
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RTA1
P53047
SUN4
YNL066W
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RTA1
P53047
RFA2
YNL312W
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RTA1
P53047
ECM2
YBR065C
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
CTR1
YPR124W
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
YBR298C-A
YBR298C-A
222 nt
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
GLE1
YDL207W
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RTA1
P53047
SNF4
YGL115W
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RTA1
P53047
PIH1
YHR034C
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RTA1
P53047
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YNL234W
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
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YNR001W-A
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
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YNR049C
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
TUB1
YML085C
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RTA1
P53047
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□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
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P53047
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YOR324C
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P53047
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YCL017C
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RTA1
P53047
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YBR132C
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RTA1
P53047
RAI1
YGL246C
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RTA1
P53047
AIM2
YAL049C
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7.23
□□□□□ -1.25
RTA1
P53047
DML1
YMR211W
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P53047
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YFL052W
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RTA1
P53047
MAD2
YJL030W
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RTA1
P53047
MTQ1
YNL063W
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RTA1
P53047
RTC4
YNL254C
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RTA1
P53047
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P53047
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RTA1
P53047
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YBL111C
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P53047
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RTA1
P53047
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YLR112W
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□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
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RTA1
P53047
YPR127W
YPR127W
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□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
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□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
DMC1
YER179W
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RTA1
P53047
YML079W
YML079W
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RTA1
P53047
PTH2
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□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
ELC1
YPL046C
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7.2
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
PAP2
YOL115W
1755 nt
7.2
□□□□□ -1.26
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