Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COPB2P35606 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COPB2P35606 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COPB2P35606 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COPB2P35606 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COPB2P35606 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COPB2P35606 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COPB2P35606 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COPB2P35606 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COPB2P35606 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
COPB2P35606 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COPB2P35606 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
COPB2P35606 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COPB2P35606 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COPB2P35606 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COPB2P35606 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COPB2P35606 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COPB2P35606 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COPB2P35606 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COPB2P35606 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COPB2P35606 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COPB2P35606 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPB2P35606 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPB2P35606 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPB2P35606 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COPB2P35606 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COPB2P35606 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COPB2P35606 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COPB2P35606 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COPB2P35606 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COPB2P35606 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COPB2P35606 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COPB2P35606 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
COPB2P35606 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COPB2P35606 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COPB2P35606 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COPB2P35606 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COPB2P35606 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COPB2P35606 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COPB2P35606 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COPB2P35606 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COPB2P35606 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COPB2P35606 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COPB2P35606 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COPB2P35606 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COPB2P35606 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COPB2P35606 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COPB2P35606 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COPB2P35606 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COPB2P35606 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COPB2P35606 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COPB2P35606 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COPB2P35606 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COPB2P35606 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPB2P35606 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPB2P35606 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPB2P35606 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
COPB2P35606 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPB2P35606 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPB2P35606 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COPB2P35606 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COPB2P35606 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COPB2P35606 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COPB2P35606 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPB2P35606 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COPB2P35606 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COPB2P35606 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COPB2P35606 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COPB2P35606 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COPB2P35606 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
COPB2P35606 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COPB2P35606 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COPB2P35606 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COPB2P35606 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COPB2P35606 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COPB2P35606 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COPB2P35606 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPB2P35606 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPB2P35606 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPB2P35606 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPB2P35606 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPB2P35606 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPB2P35606 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPB2P35606 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPB2P35606 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms