Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700067P10RikG3X8U2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700067P10RikG3X8U2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700067P10RikG3X8U2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700067P10RikG3X8U2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700067P10RikG3X8U2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms