Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifit3bE9PV48 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifit3bE9PV48 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifit3bE9PV48 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms