Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt3B0QZW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt3B0QZW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Supt3B0QZW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt3B0QZW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt3B0QZW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms