Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms