Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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