Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms