Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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