Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP1Q9UPQ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AGAP1Q9UPQ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms