Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMFRQ9UKV5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms