Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms