Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9Q9P2J2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms