Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms