Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIS18AQ9NYP9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms