Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms