Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms