Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms