Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARD11Q9BXL7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARD11Q9BXL7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms