Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms