Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms