Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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