Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms