Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARXQ96QS3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms