Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM47Q96LD4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms