Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD50Q92878 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD50Q92878 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms