Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF148Q8N7C7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RNF148Q8N7C7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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