Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms