Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SV2AQ7L0J3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SV2AQ7L0J3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms