Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C12orf54Q6X4T0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C12orf54Q6X4T0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C12orf54Q6X4T0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C12orf54Q6X4T0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C12orf54Q6X4T0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C12orf54Q6X4T0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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