Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms