Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT80Q6KB66 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms