Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms