Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP6Q5VW22 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms