Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf140Q5VVS0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177 ms