Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf220Q5T0J3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms