Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms