Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms