Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms