Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC57Q2TAC2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms