Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPHKAPQ2M3C7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
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