Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TXNRD1Q16881 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNRD1Q16881 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms