Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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