Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CCDC6Q16204 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CCDC6Q16204 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CCDC6Q16204 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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