Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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