Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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