Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHROOM2Q13796 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms