Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMB3Q13751 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms